Sau biến cố ngày 30-4-1975 tại Việt Nam, người Việt bỏ nước ra đi tìm tự do trong những chuyến vượt biên, vượt biển vội vàng, gian nguy, đầy kinh hãi. Sau những ngày trú chân đợi chờ trên các đảo miền Đông Nam Thái Bình Dương, người Việt Nam tỵ nạn đã đến các trung tâm tạm cư như Midway Hostel (Footscray), Eastbridge Hostel (Nunawading), Enterprise Hostel (Springvale) thuộc tiểu bang Victoria, Úc Đại Lợi.
Dù bỡ ngỡ trước một đất nước xa lạ với bao lo âu cho cuộc sống mới trong tương lai, nhưng lửa đức tin và nhu cầu thờ phượng Đức Chúa Trời vẫn luôn nóng cháy trong tim những người tín hữu Tin Lành. Thế là “đồng thanh tương ứng, đồng khí tương cầu”, trong tình yêu thương của Chúa, những người có cùng đức tin đến với nhau, tìm một nơi nhóm lại để thờ phượng Chúa.
Cuối năm 1979, một nhóm tín hữu tại Melbourne đã có mong ước được thành lập Hội Thánh Tin Lành Việt Nam để có nơi thờ phượng. Đến năm 1980, nữ chấp sự Doris Fletcher thuộc Hội Thánh Baptist Syndal đã đến tìm nhóm tín hữu nầy qua sự giới thiệu của Hội Thánh Tin Lành Việt Nam tại Sydney.
Ngày 10-8-1980, bà chấp sự Fletcher đã tổ chức một buổi nhóm thờ phượng đầu tiên cho nhóm tín hữu Melbourne tại nhà thờ Baptist Balwyn. Trong buổi lễ thờ phượng nầy có 28 tín hữu và thân hữu cùng ông bà Truyền đạo Đoàn Trung Chánh đến từ Hội Thánh Sydney. Ông Vũ Phúc Thái được đề cử đại diện nhóm để liên lạc, gom bó các thân, tín hữu trong việc học Kinh Thánh, cầu nguyện; đặc biệt chú ý đến đồng hương và các tín hữu mới đến định cư hiện còn đang tạm sống trong các hostels.
Lửa Thánh Linh vẫn tiếp tục hâm nóng niềm tin của những người tín hữu thuộc nhóm nhỏ đó. Hội thánh đã trải qua một chặng đường khá dài trong quá trình thành lập, tổ chức và truyền giảng với 8 lần di dời, mướn địa điểm nhóm lại.
Trung tuần tháng 11-1980, buổi truyền giảng cho người Việt nam tại nhà thờ Romanian Baptist Church tại Richmond đã được tổ chức với sự trợ giúp của bà Fletcher. Buổi truyền giảng có gần 300 người tham dự và có 12 người tin Chúa. Vì lúc đó đồng hương và tín hữu ít thông thuộc đường đi đến Richmond nên địa điểm thờ phượng đã được dời về phía Tây Melbourne vào đầu năm 1981.
Năm 1981, Hội Thánh đã được bà Paula Kelly, điều hợp viên của Hội Tỵ Nạn Đông Dương (ICRA), cho mượn nơi nhóm ở Fleming-ton. Trong giai đoạn này bà Fletcher chịu trách nhiệm chia sẻ Lời Chúa và ông David Gibson lo phần tập hát. Giáo sĩ Sutherland, Giám đốc Trường Kinh Thánh tại Canberra, cũng đến giảng và ban Tiệc Thánh.
Vào giữa năm 1981, khi số tín hữu tăng lên đến 75 người, Hội Thánh mời Thầy Truyền Đạo Trần Thống từ Canberra tới Melbourne để quản nhiệm Hội Thánh. Cuối năm 1981, Hội Thánh mượn được nhà thờ Lutheran ở 360 Barkly Street, Footscray để thờ phượng Chúa. Khi số tín hữu tăng đến 120 người, Hội Thánh đã được khải tượng mua nhà thờ.
Từ năm 1984 đến năm 1985, Hội Thánh mướn phòng nhóm tại nhà thờ Uniting Church số 215-217 Francis St, Yarraville, với số tín hữu tăng đến 150 người. Ngày 17-8-1985, Ban Tạo Mãi được thành lập, ông Vũ Phúc Thái làm trưởng ban. Mục Sư Rex Fish-er cho Hội Thánh mượn 5,000 Úc kim góp vào Quỹ Tạo Mãi.
Ngày 10-1-1986, Hội Thánh đã mua được cơ sở tại số 34-36 Ballard St, Yarraville với giá 70,000 Úc kim. Lễ Cung Hiến Đền Thờ đã được tổ chức vào ngày 9-2-1986.
Tháng 5-1990, biến cố xảy ra trong Hội Thánh Melbourne và Quản Nhiệm Trần Thống rời khỏi chức vụ. Trong 5 tháng khủng khoảng lãnh đạo, Hội Thánh đã trải qua nhiều hiểu lầm, chia rẽ. Sau đó, Tổng Hội Hội Thánh Tin Lành Việt Nam Úc Châu đề cử Mục Sư Ngô Minh Quang – Hội Trưởng, và cũng là Mục Sư Quản Nhiệm của Hội Thánh Tin Lành Việt Nam tại Springvale – kiêm nhiệm Hội Thánh Melbourne trong 7 năm (1990-1997).
Ngày 16-9-1994 Hội Thánh đã mua qua đấu giá được lô đất số 41-45 Pickett Street, Footscray. Năm sau, Hội Thánh lại mua được 2 lô đất kế bên thuộc quyền sở hữu của Hội Đồng Thành Phố Maribyrnong. Việc vẽ họa đồ xây cất nhà thờ mới được tiến hành ngay.
Tháng 1-1998, Hội Thánh mời Mục Sư Trần Thanh Tâm từ Perth về Melbourne làm Quản nhiệm Hội Thánh. Giữa năm 2000, Hội Thánh bán cơ sở tại Yarraville để hướng đến việc xây cất nhà thờ tại Footscray trên các lô đất đã mua vào thời gian 1993-1994.
Giữa năm 2000, sau khi bán cơ sở 34-36 Ballard Street, Yarraville để có ngân khoản xây cất nhà thờ mới tại số 45 Pickett Street, Footscray, Hội Thánh đã dời địa điểm nhóm thờ phượng đến Braybrook Community Centre trên Churchill Ave, Braybrook. Hội thánh tiếp tục nhóm ở đó cho đến gần cuối năm 2002 khi phần xây cất đợt một tại cơ sở mới hoàn thành. Lúc ấy, số người nhóm lại hơn 180 người.Ngày 15-4-2005, phần xây cất đợt hai được khởi công và hoàn tất ngày 20-9-2005. Thầy cô Trần Văn Hùng – Trần Thị Phước đã đứng ra vay ngân hàng $200,000 để Hội Thánh có thể khởi công xây cất đợt hai này. Lễ Cung Hiến Đền Thờ được cử hành trọng thể vào 5 giờ chiều ngày Thứ Bảy 12-11-2005.
Suốt 35 năm qua Chúa đã đồng hành với Hội Thánh. Ngài ban ơn phước dư dật, gìn giữ Hội Thánh Chúa trong ơn lành của Ngài.